时间是“大海贼时代”，某天得知故乡“东海”发生危机的草帽海贼团，打算暂时中断冒险返回东海，此时他们看到空中出现一艘莫名的海贼船，由于奈美预测到眼前即将出现暴风雨，并利用从那艘船上丢下来的“音贝”作通知，暴风雨过后海贼船的主人“金狮子”狮鬼来到千里阳光号上，表示要运用他的“飘浮果实”能力载路飞等人回到东海当作谢礼，令路飞等人相当兴奋，谁知途中狮鬼却突然解除了千里阳光号的浮力，并趁机掳走奈美，原来狮鬼看上了奈美能用身体感知气候的能力，想让她成为自己海贼团的航海士，路飞等人则跟着千里阳光号一起从上空坠落到浮游岛“STRONG WORLD”，四处分散的伙伴们被迫与岛上各种进化的凶暴珍兽战斗。
传说中的海贼“金狮子”狮鬼，其实力跟“海贼王”高路·D·罗杰与“白胡子”爱德华·纽哥特不相上下，并且从罗杰的时代就掀起大暴乱的传说海贼。20年前成为“深海大监狱”因佩尔中首位逃狱成功的囚犯，逃狱后的20年誓言要向全世界复仇的狮鬼，踏出复仇计划的第一步就是摧毁整个东海，为了保护故乡和伙伴，立志成为“海贼王”的路飞与狮鬼展开顶尖对决，到底谁能战胜并称霸这片海洋…？
